Hastane eğitim ve araştırma laboratuvarlarını, 376 yatan hasta odası, 12 ameliyathane, 55 yatak kapasiteli yoğun bakım ünitesi, 14 kemik iliği nakli yatağı, 88 gözlem yatağı ve 200 poliklinik muayene odasını içermektedir. KÜ Tıp Fakültesi öğrencileri eğitimlerinin ilk üç yılını üniversitenin Rumelifeneri Kampüsü’nde tamamladıktan sonra, dördüncü yıldan başlayarak, klinik ağırlıklı eğitimlerini Koç Üniversitesi Hastanesi’nde sürdürmektedir.
Koç Üniversitesi Hastanesi’nin mimari tasarımı hasta bakım ve tedavisine yaklaşımı yansıtmaktadır. Benimsenen şeffaflık ilkesi uyarınca, hastaların mahremiyetini korumak koşuluyla, iç mekân tasarımında yaygın olarak camdan yararlanılmıştır. Araştırmaya verilen önem nedeniyle, araştırma laboratuvarları hastane kompleksinin merkezine yerleştirilmiştir. Ayrıca, disiplinler ve bölümler arası mekânsal ayrımlardan kaçınılmış, böylece klinik uygulamalarda birbirini tamamlayan, sorgulayan ve ekip ruhuyla hareket eden bütünsel bir sistem kurulması amaçlanmıştır.